Parallellt arbetade han under Uppsalaåren som informator hos Major Urban Palmstruch på Ransta i Västmanland. Efter 7 års studier i Uppsala tog han en fil. magistergrad 1821. Han tenterade för professorn Gustav Knös som var hans morbror.

Nils skolgång var klar 1823. Samma år dog fadern och hemmet upplöstes. Nils fick uppdraget att under denna tid förestå skolpensionen under avvecklingen. Han flyttade sedan, 1824 till landshövdingen, generallöjtnanten Axel Rosen i Göteborg som informator.

Efter konditionerande därefter, på skilda läroanstalter, anställdes Nils hösten 1826 som vik. apologist vid Skara gamla skola där han sedan allt framgent skulle få sin gärning förlagd; i slutet såsom rektor, en tjänst som han innehade till sin pensionering. I mer än tio år fick Nils Ahlberg dock gå som apologist, innan befordran kom honom till del. 1838 blev han konrektor, 1845 anförtroddes åt honom vården av stiftbiliotekets skatter och två år senare 2/9 1850 utnämndes han till den första rektorn i raden av rektoret för hela läroverket.

I början av sin Skara-tid bodde Nils i ett hus på den Frölichska tomten, men när styvfadern, Carl Johan Knös dog 1835 köpte han och modern, tillsammans in den s.k. Leijonstolpeska (eller Hofska) tomten vid Östra Kungshusgatan. Med tiden fylldes de små rummen i det nya huset av allt vackert som den sköhetsälskande rektorn samlade. Här slutade också modern sina dagar.

1851 gifte sig, den nu 55-årige Nils, med en 21-år ung kvinna. Äktenskapet blev sällsynt lyckligt men barnlöst.

År 1856 kom en ny läroverksstadga, som resulterade i att Nils, som nu hunnit fylla 60 år, beslöt att dra sig tillbaka från rektorstjänsten. Året därpå lämnade han skolan helt för att ägna all kraft åt vården av biblioteket.

Hans yngre broder Jacob Julius Fredrik tillika borgmästare i Skara skriver att Nils Levinius hade ett ädelt och ömt hjärta, var tro- och vänfast förenat med djup lärdom och med finaste levnadsrespekt utan att i yttre måtto söka inge sådan; vilket mängden av hans lärjungar vid lärosätet, sedan de därifrån utgått, med tacksam hågkomst enhälligt erkänna.

1865 erhöll han Nordstjärneordern som avslutning på en lång tjänst Han hade då varit sjuk en tid. Året därpå ansåg han sig inte längre orka med att sköta stiftbiblioteket. Den åldrade gestalten syntes alltmera sällan på Skara gator. Brodern hade för länge sedan flyttat från Skara. Stilla kom slutet 1870.